Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CgnP59242 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CgnP59242 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CgnP59242 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CgnP59242 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CgnP59242 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CgnP59242 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CgnP59242 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CgnP59242 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CgnP59242 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CgnP59242 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CgnP59242 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CgnP59242 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CgnP59242 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CgnP59242 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CgnP59242 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CgnP59242 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CgnP59242 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CgnP59242 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CgnP59242 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CgnP59242 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CgnP59242 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CgnP59242 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CgnP59242 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CgnP59242 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CgnP59242 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CgnP59242 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CgnP59242 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CgnP59242 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CgnP59242 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CgnP59242 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CgnP59242 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CgnP59242 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CgnP59242 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CgnP59242 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CgnP59242 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CgnP59242 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CgnP59242 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CgnP59242 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CgnP59242 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CgnP59242 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CgnP59242 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CgnP59242 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CgnP59242 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CgnP59242 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CgnP59242 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CgnP59242 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CgnP59242 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CgnP59242 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CgnP59242 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CgnP59242 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CgnP59242 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CgnP59242 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CgnP59242 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CgnP59242 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CgnP59242 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CgnP59242 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CgnP59242 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CgnP59242 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CgnP59242 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CgnP59242 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CgnP59242 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CgnP59242 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CgnP59242 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CgnP59242 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CgnP59242 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CgnP59242 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CgnP59242 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CgnP59242 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CgnP59242 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CgnP59242 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CgnP59242 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CgnP59242 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CgnP59242 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CgnP59242 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CgnP59242 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CgnP59242 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CgnP59242 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CgnP59242 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CgnP59242 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CgnP59242 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CgnP59242 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CgnP59242 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CgnP59242 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CgnP59242 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CgnP59242 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CgnP59242 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CgnP59242 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CgnP59242 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CgnP59242 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CgnP59242 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CgnP59242 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CgnP59242 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CgnP59242 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CgnP59242 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CgnP59242 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CgnP59242 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CgnP59242 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CgnP59242 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CgnP59242 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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