Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp5P56399 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp5P56399 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp5P56399 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp5P56399 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp5P56399 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp5P56399 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp5P56399 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp5P56399 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Usp5P56399 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp5P56399 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Usp5P56399 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Usp5P56399 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp5P56399 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Usp5P56399 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Usp5P56399 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Usp5P56399 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Usp5P56399 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp5P56399 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp5P56399 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp5P56399 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp5P56399 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp5P56399 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp5P56399 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp5P56399 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp5P56399 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp5P56399 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp5P56399 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp5P56399 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp5P56399 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
Usp5P56399 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Usp5P56399 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp5P56399 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp5P56399 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp5P56399 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp5P56399 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Usp5P56399 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp5P56399 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Usp5P56399 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp5P56399 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp5P56399 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp5P56399 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp5P56399 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp5P56399 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp5P56399 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp5P56399 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Usp5P56399 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp5P56399 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp5P56399 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp5P56399 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp5P56399 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp5P56399 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp5P56399 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp5P56399 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp5P56399 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp5P56399 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp5P56399 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp5P56399 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp5P56399 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp5P56399 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp5P56399 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp5P56399 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp5P56399 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp5P56399 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp5P56399 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp5P56399 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp5P56399 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp5P56399 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp5P56399 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp5P56399 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp5P56399 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp5P56399 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp5P56399 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp5P56399 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp5P56399 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp5P56399 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp5P56399 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp5P56399 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp5P56399 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp5P56399 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp5P56399 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp5P56399 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp5P56399 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp5P56399 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp5P56399 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp5P56399 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp5P56399 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp5P56399 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp5P56399 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp5P56399 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp5P56399 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp5P56399 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp5P56399 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp5P56399 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp5P56399 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp5P56399 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp5P56399 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp5P56399 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp5P56399 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp5P56399 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms