Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
LmnaP48678 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LmnaP48678 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
LmnaP48678 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Olfr1212-201ENSMUST00000055895 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LmnaP48678 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Msantd2-204ENSMUST00000211060 2165 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LmnaP48678 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Cd59a-201ENSMUST00000040423 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LmnaP48678 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LmnaP48678 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LmnaP48678 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LmnaP48678 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LmnaP48678 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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