Protein–RNA interactions for Protein: P47955

Rplp1, 60S acidic ribosomal protein P1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rplp1P47955 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rplp1P47955 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rplp1P47955 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rplp1P47955 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rplp1P47955 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rplp1P47955 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rplp1P47955 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rplp1P47955 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rplp1P47955 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rplp1P47955 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rplp1P47955 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rplp1P47955 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rplp1P47955 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rplp1P47955 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rplp1P47955 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rplp1P47955 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rplp1P47955 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rplp1P47955 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rplp1P47955 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rplp1P47955 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rplp1P47955 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rplp1P47955 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rplp1P47955 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rplp1P47955 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rplp1P47955 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rplp1P47955 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rplp1P47955 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rplp1P47955 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rplp1P47955 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rplp1P47955 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rplp1P47955 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rplp1P47955 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rplp1P47955 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rplp1P47955 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rplp1P47955 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rplp1P47955 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rplp1P47955 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rplp1P47955 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rplp1P47955 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rplp1P47955 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rplp1P47955 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rplp1P47955 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rplp1P47955 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rplp1P47955 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rplp1P47955 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rplp1P47955 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rplp1P47955 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rplp1P47955 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rplp1P47955 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rplp1P47955 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rplp1P47955 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rplp1P47955 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rplp1P47955 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rplp1P47955 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rplp1P47955 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rplp1P47955 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rplp1P47955 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rplp1P47955 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rplp1P47955 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rplp1P47955 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rplp1P47955 Gm45733-201ENSMUST00000212988 437 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rplp1P47955 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rplp1P47955 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rplp1P47955 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rplp1P47955 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rplp1P47955 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rplp1P47955 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rplp1P47955 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rplp1P47955 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rplp1P47955 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rplp1P47955 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rplp1P47955 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rplp1P47955 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rplp1P47955 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rplp1P47955 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rplp1P47955 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rplp1P47955 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rplp1P47955 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rplp1P47955 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rplp1P47955 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rplp1P47955 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rplp1P47955 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rplp1P47955 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rplp1P47955 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rplp1P47955 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rplp1P47955 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rplp1P47955 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rplp1P47955 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rplp1P47955 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rplp1P47955 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rplp1P47955 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rplp1P47955 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rplp1P47955 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rplp1P47955 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rplp1P47955 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rplp1P47955 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rplp1P47955 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rplp1P47955 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rplp1P47955 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rplp1P47955 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms