Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms