Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkx1-2P42580 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms