Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddit3P35639 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms