Protein–RNA interactions for Protein: P35278

Rab5c, Ras-related protein Rab-5C, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5cP35278 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Rab5cP35278 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
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Rab5cP35278 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Rab5cP35278 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Rab5cP35278 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Rab5cP35278 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Rab5cP35278 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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