Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms