Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChgaP26339 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Gm37612-201ENSMUST00000193626 582 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Olfr202-202ENSMUST00000201687 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Ndufc1-201ENSMUST00000038108 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Milr1-202ENSMUST00000106794 1514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChgaP26339 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChgaP26339 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ChgaP26339 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChgaP26339 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChgaP26339 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChgaP26339 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms