Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms