Protein–RNA interactions for Protein: P14733

Lmnb1, Lamin-B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb1P14733 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms