Protein–RNA interactions for Protein: P10856

Tnp1, Spermatid nuclear transition protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp1P10856 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Klhdc7a-201ENSMUST00000105031 7807 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Hdac4-202ENSMUST00000097644 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Ddx6-203ENSMUST00000217034 6029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Plekha7-207ENSMUST00000182511 4502 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Rrm2b-201ENSMUST00000022901 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Prdm16-206ENSMUST00000105638 8601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Tbcel-203ENSMUST00000125995 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Nup214-201ENSMUST00000065398 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Helz2-202ENSMUST00000108831 10109 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Arhgap21-208ENSMUST00000141298 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms