Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P10404 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P10404 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P10404 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P10404 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P10404 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P10404 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P10404 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P10404 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P10404 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P10404 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P10404 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P10404 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P10404 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P10404 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P10404 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P10404 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P10404 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P10404 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P10404 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P10404 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P10404 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P10404 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P10404 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P10404 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P10404 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P10404 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P10404 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P10404 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P10404 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P10404 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P10404 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P10404 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P10404 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P10404 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
P10404 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P10404 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
P10404 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P10404 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
P10404 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P10404 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P10404 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P10404 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
P10404 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P10404 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P10404 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P10404 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P10404 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P10404 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P10404 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P10404 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P10404 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P10404 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P10404 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
P10404 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P10404 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P10404 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P10404 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P10404 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P10404 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P10404 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P10404 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P10404 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P10404 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
P10404 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P10404 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P10404 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P10404 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P10404 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P10404 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P10404 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P10404 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P10404 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P10404 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P10404 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P10404 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P10404 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P10404 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
P10404 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P10404 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P10404 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P10404 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P10404 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P10404 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P10404 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P10404 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P10404 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
P10404 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
P10404 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P10404 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P10404 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P10404 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P10404 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
P10404 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P10404 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P10404 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
P10404 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
P10404 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P10404 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
P10404 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.6 ms