Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Surf1P09925 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Surf1P09925 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Surf1P09925 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Surf1P09925 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Surf1P09925 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Surf1P09925 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Surf1P09925 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Surf1P09925 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Surf1P09925 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms