Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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PdgfrbP05622 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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PdgfrbP05622 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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PdgfrbP05622 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
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PdgfrbP05622 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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PdgfrbP05622 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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PdgfrbP05622 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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PdgfrbP05622 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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PdgfrbP05622 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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PdgfrbP05622 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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PdgfrbP05622 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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PdgfrbP05622 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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PdgfrbP05622 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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