Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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