Protein–RNA interactions for Protein: O54949

Nlk, Serine/threonine-protein kinase NLK, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NlkO54949 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NlkO54949 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NlkO54949 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
NlkO54949 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NlkO54949 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NlkO54949 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NlkO54949 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NlkO54949 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NlkO54949 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NlkO54949 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NlkO54949 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
NlkO54949 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
NlkO54949 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NlkO54949 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NlkO54949 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
NlkO54949 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NlkO54949 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NlkO54949 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NlkO54949 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NlkO54949 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NlkO54949 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
NlkO54949 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
NlkO54949 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NlkO54949 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
NlkO54949 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NlkO54949 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NlkO54949 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
NlkO54949 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
NlkO54949 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NlkO54949 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NlkO54949 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NlkO54949 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
NlkO54949 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NlkO54949 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NlkO54949 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
NlkO54949 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NlkO54949 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NlkO54949 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NlkO54949 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NlkO54949 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NlkO54949 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NlkO54949 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NlkO54949 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NlkO54949 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NlkO54949 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NlkO54949 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NlkO54949 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NlkO54949 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NlkO54949 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NlkO54949 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NlkO54949 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NlkO54949 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NlkO54949 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
NlkO54949 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NlkO54949 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NlkO54949 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NlkO54949 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NlkO54949 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NlkO54949 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NlkO54949 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
NlkO54949 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
NlkO54949 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NlkO54949 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NlkO54949 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
NlkO54949 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NlkO54949 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NlkO54949 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NlkO54949 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NlkO54949 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NlkO54949 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NlkO54949 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NlkO54949 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NlkO54949 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NlkO54949 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NlkO54949 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NlkO54949 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NlkO54949 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NlkO54949 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NlkO54949 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NlkO54949 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NlkO54949 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NlkO54949 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NlkO54949 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NlkO54949 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NlkO54949 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NlkO54949 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NlkO54949 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NlkO54949 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NlkO54949 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NlkO54949 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NlkO54949 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NlkO54949 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NlkO54949 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NlkO54949 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NlkO54949 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NlkO54949 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NlkO54949 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NlkO54949 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NlkO54949 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NlkO54949 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms