Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
FxnO35943 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
FxnO35943 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
FxnO35943 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
FxnO35943 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
FxnO35943 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
FxnO35943 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
FxnO35943 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
FxnO35943 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FxnO35943 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FxnO35943 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FxnO35943 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FxnO35943 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FxnO35943 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
FxnO35943 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FxnO35943 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FxnO35943 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FxnO35943 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
FxnO35943 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FxnO35943 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
FxnO35943 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FxnO35943 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FxnO35943 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FxnO35943 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FxnO35943 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FxnO35943 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FxnO35943 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FxnO35943 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FxnO35943 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FxnO35943 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FxnO35943 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FxnO35943 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FxnO35943 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FxnO35943 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FxnO35943 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FxnO35943 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FxnO35943 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FxnO35943 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FxnO35943 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FxnO35943 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FxnO35943 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FxnO35943 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FxnO35943 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
FxnO35943 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FxnO35943 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FxnO35943 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
FxnO35943 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FxnO35943 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FxnO35943 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FxnO35943 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FxnO35943 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FxnO35943 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
FxnO35943 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FxnO35943 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FxnO35943 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FxnO35943 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FxnO35943 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FxnO35943 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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FxnO35943 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FxnO35943 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FxnO35943 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FxnO35943 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FxnO35943 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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FxnO35943 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FxnO35943 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FxnO35943 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FxnO35943 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FxnO35943 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FxnO35943 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FxnO35943 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FxnO35943 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FxnO35943 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FxnO35943 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FxnO35943 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FxnO35943 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FxnO35943 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FxnO35943 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FxnO35943 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FxnO35943 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FxnO35943 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
FxnO35943 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
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