Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Ccdc7a-201ENSMUST00000095158 1547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Ctdspl2-203ENSMUST00000110574 1616 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Trbv20-201ENSMUST00000103277 335 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Gm12737-201ENSMUST00000142835 725 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Gm22588-201ENSMUST00000157510 140 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Gm16243-201ENSMUST00000160351 494 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Gm5795-202ENSMUST00000166275 612 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Gm8279-203ENSMUST00000170040 612 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Gm10413-202ENSMUST00000177913 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Gm3424-202ENSMUST00000178418 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Gm3187-201ENSMUST00000178429 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Gm10338-202ENSMUST00000178623 612 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Gm3012-202ENSMUST00000179486 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Gm3489-201ENSMUST00000190083 528 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Gm8952-201ENSMUST00000206828 1102 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Olfr27-201ENSMUST00000214052 1076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Clec2g-202ENSMUST00000075789 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Gm22977-201ENSMUST00000082615 107 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lhx8O35652 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Esp3-201ENSMUST00000177574 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Gm20679-201ENSMUST00000177285 1402 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Gm43869-201ENSMUST00000204742 1405 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Snord70-201ENSMUST00000104157 87 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Mrps36-203ENSMUST00000109333 701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Gm14480-201ENSMUST00000118521 433 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Scgb1b27-202ENSMUST00000173387 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Odaph-201ENSMUST00000178614 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Tac1-205ENSMUST00000185187 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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