Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Slc27a2O35488 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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