Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms