Protein–RNA interactions for Protein: L7N216

Speer4d, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4D, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4dL7N216 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Speer4dL7N216 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Speer4dL7N216 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Speer4dL7N216 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Speer4dL7N216 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Speer4dL7N216 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Speer4dL7N216 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Speer4dL7N216 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Speer4dL7N216 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Speer4dL7N216 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Speer4dL7N216 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Speer4dL7N216 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Speer4dL7N216 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Speer4dL7N216 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Speer4dL7N216 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Speer4dL7N216 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Speer4dL7N216 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Speer4dL7N216 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Speer4dL7N216 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Speer4dL7N216 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Speer4dL7N216 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Speer4dL7N216 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Speer4dL7N216 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Speer4dL7N216 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Speer4dL7N216 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Speer4dL7N216 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Speer4dL7N216 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Speer4dL7N216 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Speer4dL7N216 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Speer4dL7N216 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Speer4dL7N216 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Speer4dL7N216 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Speer4dL7N216 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Speer4dL7N216 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Speer4dL7N216 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Speer4dL7N216 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Speer4dL7N216 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Speer4dL7N216 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Speer4dL7N216 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Speer4dL7N216 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Speer4dL7N216 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Speer4dL7N216 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Speer4dL7N216 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Speer4dL7N216 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Speer4dL7N216 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Speer4dL7N216 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Speer4dL7N216 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Speer4dL7N216 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Speer4dL7N216 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Speer4dL7N216 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Speer4dL7N216 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Speer4dL7N216 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Speer4dL7N216 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Speer4dL7N216 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Speer4dL7N216 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Speer4dL7N216 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Speer4dL7N216 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Speer4dL7N216 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Speer4dL7N216 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Speer4dL7N216 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Speer4dL7N216 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Speer4dL7N216 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Speer4dL7N216 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Speer4dL7N216 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Speer4dL7N216 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Speer4dL7N216 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Speer4dL7N216 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Speer4dL7N216 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Speer4dL7N216 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Speer4dL7N216 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Speer4dL7N216 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Speer4dL7N216 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Speer4dL7N216 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Speer4dL7N216 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Speer4dL7N216 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Speer4dL7N216 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Speer4dL7N216 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Speer4dL7N216 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Speer4dL7N216 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Speer4dL7N216 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Speer4dL7N216 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Speer4dL7N216 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Speer4dL7N216 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Speer4dL7N216 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4dL7N216 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4dL7N216 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4dL7N216 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4dL7N216 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4dL7N216 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4dL7N216 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4dL7N216 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4dL7N216 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4dL7N216 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4dL7N216 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4dL7N216 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4dL7N216 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4dL7N216 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4dL7N216 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4dL7N216 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4dL7N216 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms