Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ23

Gm21310, Predicted gene, 21310, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21310J3QQ23 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Gm21310J3QQ23 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Gm21310J3QQ23 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Gm21310J3QQ23 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
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