Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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