Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms