Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

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Length 633 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Zfp988F6VKC7 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Zfp988F6VKC7 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Zfp988F6VKC7 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Zfp988F6VKC7 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Zfp988F6VKC7 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Zfp988F6VKC7 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Zfp988F6VKC7 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Zfp988F6VKC7 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Zfp988F6VKC7 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Zfp988F6VKC7 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Zfp988F6VKC7 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
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Zfp988F6VKC7 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Zfp988F6VKC7 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Zfp988F6VKC7 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Zfp988F6VKC7 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Zfp988F6VKC7 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Zfp988F6VKC7 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Zfp988F6VKC7 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Zfp988F6VKC7 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Zfp988F6VKC7 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Zfp988F6VKC7 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Zfp988F6VKC7 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Zfp988F6VKC7 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Zfp988F6VKC7 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Zfp988F6VKC7 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Zfp988F6VKC7 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Zfp988F6VKC7 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Zfp988F6VKC7 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Zfp988F6VKC7 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Zfp988F6VKC7 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Zfp988F6VKC7 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Zfp988F6VKC7 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Zfp988F6VKC7 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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