Protein–RNA interactions for Protein: E9Q007

Gm4450, Predicted gene 4450, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4450E9Q007 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm4450E9Q007 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm4450E9Q007 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm4450E9Q007 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm4450E9Q007 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm4450E9Q007 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm4450E9Q007 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm4450E9Q007 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm4450E9Q007 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm4450E9Q007 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm4450E9Q007 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm4450E9Q007 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm4450E9Q007 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm4450E9Q007 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm4450E9Q007 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm4450E9Q007 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm4450E9Q007 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm4450E9Q007 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm4450E9Q007 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm4450E9Q007 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm4450E9Q007 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm4450E9Q007 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm4450E9Q007 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm4450E9Q007 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm4450E9Q007 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm4450E9Q007 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm4450E9Q007 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm4450E9Q007 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm4450E9Q007 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm4450E9Q007 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm4450E9Q007 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm4450E9Q007 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm4450E9Q007 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm4450E9Q007 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm4450E9Q007 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Gm4450E9Q007 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm4450E9Q007 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm4450E9Q007 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm4450E9Q007 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm4450E9Q007 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm4450E9Q007 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm4450E9Q007 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm4450E9Q007 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm4450E9Q007 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm4450E9Q007 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm4450E9Q007 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Gm4450E9Q007 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm4450E9Q007 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm4450E9Q007 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm4450E9Q007 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm4450E9Q007 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm4450E9Q007 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm4450E9Q007 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm4450E9Q007 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm4450E9Q007 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm4450E9Q007 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Gm4450E9Q007 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm4450E9Q007 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm4450E9Q007 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm4450E9Q007 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm4450E9Q007 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm4450E9Q007 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
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Gm4450E9Q007 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Gm4450E9Q007 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm4450E9Q007 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm4450E9Q007 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm4450E9Q007 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm4450E9Q007 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm4450E9Q007 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm4450E9Q007 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm4450E9Q007 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm4450E9Q007 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm4450E9Q007 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm4450E9Q007 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm4450E9Q007 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm4450E9Q007 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm4450E9Q007 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm4450E9Q007 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm4450E9Q007 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm4450E9Q007 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm4450E9Q007 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm4450E9Q007 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm4450E9Q007 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm4450E9Q007 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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