Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms