Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

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Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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