Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Rd3lB2RV38 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Rd3lB2RV38 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Rd3lB2RV38 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Rd3lB2RV38 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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