Protein–RNA interactions for Protein: B2RUR8

Otud7b, OTU domain-containing protein 7B, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud7bB2RUR8 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Otud7bB2RUR8 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Otud7bB2RUR8 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Otud7bB2RUR8 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Otud7bB2RUR8 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Otud7bB2RUR8 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Otud7bB2RUR8 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Otud7bB2RUR8 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Otud7bB2RUR8 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Otud7bB2RUR8 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Otud7bB2RUR8 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Otud7bB2RUR8 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Otud7bB2RUR8 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Otud7bB2RUR8 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Otud7bB2RUR8 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otud7bB2RUR8 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otud7bB2RUR8 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otud7bB2RUR8 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otud7bB2RUR8 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otud7bB2RUR8 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otud7bB2RUR8 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Otud7bB2RUR8 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otud7bB2RUR8 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Otud7bB2RUR8 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otud7bB2RUR8 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otud7bB2RUR8 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otud7bB2RUR8 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otud7bB2RUR8 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otud7bB2RUR8 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otud7bB2RUR8 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otud7bB2RUR8 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otud7bB2RUR8 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otud7bB2RUR8 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otud7bB2RUR8 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Otud7bB2RUR8 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Otud7bB2RUR8 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otud7bB2RUR8 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otud7bB2RUR8 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otud7bB2RUR8 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otud7bB2RUR8 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otud7bB2RUR8 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Otud7bB2RUR8 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Otud7bB2RUR8 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otud7bB2RUR8 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Otud7bB2RUR8 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Otud7bB2RUR8 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Otud7bB2RUR8 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otud7bB2RUR8 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otud7bB2RUR8 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otud7bB2RUR8 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otud7bB2RUR8 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otud7bB2RUR8 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otud7bB2RUR8 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otud7bB2RUR8 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otud7bB2RUR8 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otud7bB2RUR8 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otud7bB2RUR8 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otud7bB2RUR8 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otud7bB2RUR8 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otud7bB2RUR8 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otud7bB2RUR8 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Otud7bB2RUR8 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otud7bB2RUR8 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otud7bB2RUR8 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otud7bB2RUR8 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otud7bB2RUR8 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otud7bB2RUR8 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otud7bB2RUR8 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otud7bB2RUR8 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otud7bB2RUR8 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otud7bB2RUR8 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otud7bB2RUR8 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otud7bB2RUR8 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otud7bB2RUR8 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otud7bB2RUR8 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Otud7bB2RUR8 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Otud7bB2RUR8 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Otud7bB2RUR8 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otud7bB2RUR8 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otud7bB2RUR8 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Otud7bB2RUR8 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otud7bB2RUR8 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otud7bB2RUR8 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otud7bB2RUR8 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Otud7bB2RUR8 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otud7bB2RUR8 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otud7bB2RUR8 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otud7bB2RUR8 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otud7bB2RUR8 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otud7bB2RUR8 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otud7bB2RUR8 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otud7bB2RUR8 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otud7bB2RUR8 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otud7bB2RUR8 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otud7bB2RUR8 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otud7bB2RUR8 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otud7bB2RUR8 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otud7bB2RUR8 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Otud7bB2RUR8 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Otud7bB2RUR8 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms