Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rrn3B2RS91 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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