Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms