Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms