Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms