Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Prdm16A2A935 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prdm16A2A935 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prdm16A2A935 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Prdm16A2A935 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prdm16A2A935 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prdm16A2A935 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prdm16A2A935 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prdm16A2A935 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prdm16A2A935 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prdm16A2A935 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prdm16A2A935 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Prdm16A2A935 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prdm16A2A935 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prdm16A2A935 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prdm16A2A935 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prdm16A2A935 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Prdm16A2A935 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prdm16A2A935 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prdm16A2A935 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Prdm16A2A935 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Prdm16A2A935 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prdm16A2A935 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prdm16A2A935 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prdm16A2A935 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prdm16A2A935 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prdm16A2A935 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prdm16A2A935 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prdm16A2A935 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prdm16A2A935 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prdm16A2A935 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prdm16A2A935 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prdm16A2A935 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prdm16A2A935 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm16A2A935 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm16A2A935 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm16A2A935 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm16A2A935 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm16A2A935 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm16A2A935 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm16A2A935 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Prdm16A2A935 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm16A2A935 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Prdm16A2A935 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm16A2A935 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm16A2A935 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm16A2A935 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm16A2A935 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm16A2A935 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm16A2A935 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm16A2A935 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm16A2A935 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm16A2A935 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm16A2A935 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm16A2A935 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm16A2A935 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm16A2A935 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm16A2A935 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm16A2A935 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm16A2A935 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm16A2A935 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm16A2A935 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm16A2A935 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm16A2A935 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm16A2A935 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm16A2A935 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm16A2A935 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm16A2A935 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm16A2A935 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm16A2A935 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm16A2A935 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm16A2A935 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm16A2A935 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm16A2A935 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm16A2A935 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm16A2A935 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm16A2A935 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm16A2A935 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm16A2A935 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm16A2A935 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm16A2A935 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm16A2A935 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Prdm16A2A935 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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