Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprfA2A8L5 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
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PtprfA2A8L5 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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PtprfA2A8L5 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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PtprfA2A8L5 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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PtprfA2A8L5 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PtprfA2A8L5 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
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