Protein–RNA interactions for Protein: A2A5N3

Pabpc1l, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1lA2A5N3 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc1lA2A5N3 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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