Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV55

Vapa, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapaQ9WV55 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VapaQ9WV55 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VapaQ9WV55 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VapaQ9WV55 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VapaQ9WV55 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VapaQ9WV55 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VapaQ9WV55 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VapaQ9WV55 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VapaQ9WV55 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VapaQ9WV55 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VapaQ9WV55 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VapaQ9WV55 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VapaQ9WV55 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VapaQ9WV55 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VapaQ9WV55 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VapaQ9WV55 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VapaQ9WV55 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VapaQ9WV55 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VapaQ9WV55 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VapaQ9WV55 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VapaQ9WV55 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VapaQ9WV55 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VapaQ9WV55 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VapaQ9WV55 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VapaQ9WV55 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VapaQ9WV55 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VapaQ9WV55 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VapaQ9WV55 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VapaQ9WV55 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VapaQ9WV55 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VapaQ9WV55 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
VapaQ9WV55 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VapaQ9WV55 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VapaQ9WV55 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VapaQ9WV55 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VapaQ9WV55 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VapaQ9WV55 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VapaQ9WV55 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VapaQ9WV55 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VapaQ9WV55 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
VapaQ9WV55 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VapaQ9WV55 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VapaQ9WV55 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VapaQ9WV55 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VapaQ9WV55 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VapaQ9WV55 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VapaQ9WV55 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VapaQ9WV55 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VapaQ9WV55 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VapaQ9WV55 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VapaQ9WV55 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VapaQ9WV55 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VapaQ9WV55 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VapaQ9WV55 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VapaQ9WV55 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VapaQ9WV55 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VapaQ9WV55 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VapaQ9WV55 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VapaQ9WV55 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VapaQ9WV55 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VapaQ9WV55 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VapaQ9WV55 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VapaQ9WV55 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VapaQ9WV55 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VapaQ9WV55 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VapaQ9WV55 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VapaQ9WV55 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
VapaQ9WV55 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VapaQ9WV55 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VapaQ9WV55 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VapaQ9WV55 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VapaQ9WV55 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VapaQ9WV55 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VapaQ9WV55 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VapaQ9WV55 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VapaQ9WV55 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
VapaQ9WV55 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VapaQ9WV55 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VapaQ9WV55 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VapaQ9WV55 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
VapaQ9WV55 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VapaQ9WV55 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VapaQ9WV55 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VapaQ9WV55 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VapaQ9WV55 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VapaQ9WV55 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VapaQ9WV55 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
VapaQ9WV55 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VapaQ9WV55 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
VapaQ9WV55 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VapaQ9WV55 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VapaQ9WV55 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VapaQ9WV55 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VapaQ9WV55 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VapaQ9WV55 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VapaQ9WV55 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VapaQ9WV55 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VapaQ9WV55 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VapaQ9WV55 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VapaQ9WV55 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.3 ms