Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL0

Ripk3, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk3Q9QZL0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ripk3Q9QZL0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ripk3Q9QZL0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ripk3Q9QZL0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ripk3Q9QZL0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ripk3Q9QZL0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ripk3Q9QZL0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ripk3Q9QZL0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ripk3Q9QZL0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ripk3Q9QZL0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ripk3Q9QZL0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ripk3Q9QZL0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ripk3Q9QZL0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ripk3Q9QZL0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ripk3Q9QZL0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ripk3Q9QZL0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ripk3Q9QZL0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ripk3Q9QZL0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ripk3Q9QZL0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ripk3Q9QZL0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ripk3Q9QZL0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ripk3Q9QZL0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ripk3Q9QZL0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ripk3Q9QZL0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ripk3Q9QZL0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ripk3Q9QZL0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ripk3Q9QZL0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ripk3Q9QZL0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ripk3Q9QZL0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ripk3Q9QZL0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ripk3Q9QZL0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ripk3Q9QZL0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ripk3Q9QZL0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ripk3Q9QZL0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ripk3Q9QZL0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ripk3Q9QZL0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ripk3Q9QZL0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ripk3Q9QZL0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ripk3Q9QZL0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ripk3Q9QZL0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ripk3Q9QZL0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ripk3Q9QZL0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ripk3Q9QZL0 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ripk3Q9QZL0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ripk3Q9QZL0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ripk3Q9QZL0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ripk3Q9QZL0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ripk3Q9QZL0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ripk3Q9QZL0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ripk3Q9QZL0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ripk3Q9QZL0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ripk3Q9QZL0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ripk3Q9QZL0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ripk3Q9QZL0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ripk3Q9QZL0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ripk3Q9QZL0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ripk3Q9QZL0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ripk3Q9QZL0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ripk3Q9QZL0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ripk3Q9QZL0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ripk3Q9QZL0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ripk3Q9QZL0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ripk3Q9QZL0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ripk3Q9QZL0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ripk3Q9QZL0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ripk3Q9QZL0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ripk3Q9QZL0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ripk3Q9QZL0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ripk3Q9QZL0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ripk3Q9QZL0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ripk3Q9QZL0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ripk3Q9QZL0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ripk3Q9QZL0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ripk3Q9QZL0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ripk3Q9QZL0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ripk3Q9QZL0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ripk3Q9QZL0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ripk3Q9QZL0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ripk3Q9QZL0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ripk3Q9QZL0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ripk3Q9QZL0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ripk3Q9QZL0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ripk3Q9QZL0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ripk3Q9QZL0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ripk3Q9QZL0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ripk3Q9QZL0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ripk3Q9QZL0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ripk3Q9QZL0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ripk3Q9QZL0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ripk3Q9QZL0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ripk3Q9QZL0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ripk3Q9QZL0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ripk3Q9QZL0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ripk3Q9QZL0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ripk3Q9QZL0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ripk3Q9QZL0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ripk3Q9QZL0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ripk3Q9QZL0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ripk3Q9QZL0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ripk3Q9QZL0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms