Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cdkl2Q9QUK0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cdkl2Q9QUK0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cdkl2Q9QUK0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cdkl2Q9QUK0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cdkl2Q9QUK0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Cdkl2Q9QUK0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cdkl2Q9QUK0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cdkl2Q9QUK0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cdkl2Q9QUK0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cdkl2Q9QUK0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Cdkl2Q9QUK0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cdkl2Q9QUK0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cdkl2Q9QUK0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cdkl2Q9QUK0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cdkl2Q9QUK0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cdkl2Q9QUK0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Cdkl2Q9QUK0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cdkl2Q9QUK0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cdkl2Q9QUK0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cdkl2Q9QUK0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Cdkl2Q9QUK0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Cdkl2Q9QUK0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cdkl2Q9QUK0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Cdkl2Q9QUK0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cdkl2Q9QUK0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cdkl2Q9QUK0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cdkl2Q9QUK0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cdkl2Q9QUK0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Cdkl2Q9QUK0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cdkl2Q9QUK0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cdkl2Q9QUK0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cdkl2Q9QUK0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cdkl2Q9QUK0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cdkl2Q9QUK0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cdkl2Q9QUK0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cdkl2Q9QUK0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cdkl2Q9QUK0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cdkl2Q9QUK0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cdkl2Q9QUK0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cdkl2Q9QUK0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cdkl2Q9QUK0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cdkl2Q9QUK0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cdkl2Q9QUK0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cdkl2Q9QUK0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cdkl2Q9QUK0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cdkl2Q9QUK0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cdkl2Q9QUK0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cdkl2Q9QUK0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cdkl2Q9QUK0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cdkl2Q9QUK0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cdkl2Q9QUK0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cdkl2Q9QUK0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cdkl2Q9QUK0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cdkl2Q9QUK0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Cdkl2Q9QUK0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cdkl2Q9QUK0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cdkl2Q9QUK0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cdkl2Q9QUK0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cdkl2Q9QUK0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cdkl2Q9QUK0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cdkl2Q9QUK0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cdkl2Q9QUK0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cdkl2Q9QUK0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cdkl2Q9QUK0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdkl2Q9QUK0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdkl2Q9QUK0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdkl2Q9QUK0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdkl2Q9QUK0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdkl2Q9QUK0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdkl2Q9QUK0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdkl2Q9QUK0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdkl2Q9QUK0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdkl2Q9QUK0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdkl2Q9QUK0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdkl2Q9QUK0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdkl2Q9QUK0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdkl2Q9QUK0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdkl2Q9QUK0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdkl2Q9QUK0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdkl2Q9QUK0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdkl2Q9QUK0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdkl2Q9QUK0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdkl2Q9QUK0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdkl2Q9QUK0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdkl2Q9QUK0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdkl2Q9QUK0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdkl2Q9QUK0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdkl2Q9QUK0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdkl2Q9QUK0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdkl2Q9QUK0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cdkl2Q9QUK0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cdkl2Q9QUK0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cdkl2Q9QUK0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cdkl2Q9QUK0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cdkl2Q9QUK0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cdkl2Q9QUK0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cdkl2Q9QUK0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cdkl2Q9QUK0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cdkl2Q9QUK0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms