Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SrfQ9JM73 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SrfQ9JM73 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SrfQ9JM73 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SrfQ9JM73 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SrfQ9JM73 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SrfQ9JM73 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SrfQ9JM73 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SrfQ9JM73 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SrfQ9JM73 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SrfQ9JM73 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SrfQ9JM73 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SrfQ9JM73 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SrfQ9JM73 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SrfQ9JM73 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SrfQ9JM73 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SrfQ9JM73 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SrfQ9JM73 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SrfQ9JM73 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SrfQ9JM73 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SrfQ9JM73 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SrfQ9JM73 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SrfQ9JM73 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SrfQ9JM73 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SrfQ9JM73 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SrfQ9JM73 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SrfQ9JM73 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SrfQ9JM73 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SrfQ9JM73 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SrfQ9JM73 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SrfQ9JM73 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SrfQ9JM73 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SrfQ9JM73 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SrfQ9JM73 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SrfQ9JM73 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SrfQ9JM73 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SrfQ9JM73 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SrfQ9JM73 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SrfQ9JM73 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SrfQ9JM73 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SrfQ9JM73 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SrfQ9JM73 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SrfQ9JM73 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SrfQ9JM73 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SrfQ9JM73 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SrfQ9JM73 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SrfQ9JM73 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SrfQ9JM73 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SrfQ9JM73 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SrfQ9JM73 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SrfQ9JM73 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SrfQ9JM73 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SrfQ9JM73 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SrfQ9JM73 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SrfQ9JM73 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SrfQ9JM73 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SrfQ9JM73 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SrfQ9JM73 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SrfQ9JM73 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SrfQ9JM73 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SrfQ9JM73 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SrfQ9JM73 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SrfQ9JM73 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SrfQ9JM73 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SrfQ9JM73 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SrfQ9JM73 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SrfQ9JM73 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SrfQ9JM73 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SrfQ9JM73 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SrfQ9JM73 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SrfQ9JM73 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SrfQ9JM73 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SrfQ9JM73 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SrfQ9JM73 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SrfQ9JM73 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SrfQ9JM73 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SrfQ9JM73 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SrfQ9JM73 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SrfQ9JM73 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SrfQ9JM73 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SrfQ9JM73 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SrfQ9JM73 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SrfQ9JM73 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SrfQ9JM73 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SrfQ9JM73 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SrfQ9JM73 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SrfQ9JM73 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SrfQ9JM73 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SrfQ9JM73 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SrfQ9JM73 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SrfQ9JM73 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SrfQ9JM73 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SrfQ9JM73 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SrfQ9JM73 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SrfQ9JM73 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SrfQ9JM73 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SrfQ9JM73 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SrfQ9JM73 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SrfQ9JM73 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SrfQ9JM73 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms