Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AtrQ9JKK8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AtrQ9JKK8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AtrQ9JKK8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AtrQ9JKK8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
AtrQ9JKK8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AtrQ9JKK8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AtrQ9JKK8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AtrQ9JKK8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AtrQ9JKK8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
AtrQ9JKK8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
AtrQ9JKK8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
AtrQ9JKK8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
AtrQ9JKK8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
AtrQ9JKK8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AtrQ9JKK8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AtrQ9JKK8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AtrQ9JKK8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AtrQ9JKK8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AtrQ9JKK8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
AtrQ9JKK8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
AtrQ9JKK8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
AtrQ9JKK8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
AtrQ9JKK8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
AtrQ9JKK8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
AtrQ9JKK8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
AtrQ9JKK8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
AtrQ9JKK8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
AtrQ9JKK8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
AtrQ9JKK8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
AtrQ9JKK8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
AtrQ9JKK8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
AtrQ9JKK8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
AtrQ9JKK8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
AtrQ9JKK8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
AtrQ9JKK8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
AtrQ9JKK8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
AtrQ9JKK8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
AtrQ9JKK8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
AtrQ9JKK8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
AtrQ9JKK8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
AtrQ9JKK8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
AtrQ9JKK8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
AtrQ9JKK8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
AtrQ9JKK8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
AtrQ9JKK8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
AtrQ9JKK8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
AtrQ9JKK8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
AtrQ9JKK8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
AtrQ9JKK8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
AtrQ9JKK8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
AtrQ9JKK8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
AtrQ9JKK8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
AtrQ9JKK8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
AtrQ9JKK8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
AtrQ9JKK8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
AtrQ9JKK8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
AtrQ9JKK8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
AtrQ9JKK8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
AtrQ9JKK8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
AtrQ9JKK8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
AtrQ9JKK8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
AtrQ9JKK8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
AtrQ9JKK8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
AtrQ9JKK8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
AtrQ9JKK8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
AtrQ9JKK8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
AtrQ9JKK8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
AtrQ9JKK8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
AtrQ9JKK8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
AtrQ9JKK8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
AtrQ9JKK8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AtrQ9JKK8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
AtrQ9JKK8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AtrQ9JKK8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
AtrQ9JKK8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AtrQ9JKK8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
AtrQ9JKK8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AtrQ9JKK8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
AtrQ9JKK8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
AtrQ9JKK8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
AtrQ9JKK8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
AtrQ9JKK8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
AtrQ9JKK8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
AtrQ9JKK8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
AtrQ9JKK8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
AtrQ9JKK8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AtrQ9JKK8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AtrQ9JKK8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
AtrQ9JKK8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AtrQ9JKK8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AtrQ9JKK8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
AtrQ9JKK8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
AtrQ9JKK8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
AtrQ9JKK8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
AtrQ9JKK8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
AtrQ9JKK8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
AtrQ9JKK8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
AtrQ9JKK8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AtrQ9JKK8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms