Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR7

Ascl3, Achaete-scute homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl3Q9JJR7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ascl3Q9JJR7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ascl3Q9JJR7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ascl3Q9JJR7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ascl3Q9JJR7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ascl3Q9JJR7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ascl3Q9JJR7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ascl3Q9JJR7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ascl3Q9JJR7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ascl3Q9JJR7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ascl3Q9JJR7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ascl3Q9JJR7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ascl3Q9JJR7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ascl3Q9JJR7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ascl3Q9JJR7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ascl3Q9JJR7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ascl3Q9JJR7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ascl3Q9JJR7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ascl3Q9JJR7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ascl3Q9JJR7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ascl3Q9JJR7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ascl3Q9JJR7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ascl3Q9JJR7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ascl3Q9JJR7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ascl3Q9JJR7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ascl3Q9JJR7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ascl3Q9JJR7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ascl3Q9JJR7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ascl3Q9JJR7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ascl3Q9JJR7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ascl3Q9JJR7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ascl3Q9JJR7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ascl3Q9JJR7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ascl3Q9JJR7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ascl3Q9JJR7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ascl3Q9JJR7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ascl3Q9JJR7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ascl3Q9JJR7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ascl3Q9JJR7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ascl3Q9JJR7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ascl3Q9JJR7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ascl3Q9JJR7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ascl3Q9JJR7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ascl3Q9JJR7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ascl3Q9JJR7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ascl3Q9JJR7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ascl3Q9JJR7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ascl3Q9JJR7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ascl3Q9JJR7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ascl3Q9JJR7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ascl3Q9JJR7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ascl3Q9JJR7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ascl3Q9JJR7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ascl3Q9JJR7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ascl3Q9JJR7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ascl3Q9JJR7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ascl3Q9JJR7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ascl3Q9JJR7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ascl3Q9JJR7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ascl3Q9JJR7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ascl3Q9JJR7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ascl3Q9JJR7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ascl3Q9JJR7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ascl3Q9JJR7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ascl3Q9JJR7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ascl3Q9JJR7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ascl3Q9JJR7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ascl3Q9JJR7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ascl3Q9JJR7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ascl3Q9JJR7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ascl3Q9JJR7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ascl3Q9JJR7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ascl3Q9JJR7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ascl3Q9JJR7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ascl3Q9JJR7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ascl3Q9JJR7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ascl3Q9JJR7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ascl3Q9JJR7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ascl3Q9JJR7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ascl3Q9JJR7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ascl3Q9JJR7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ascl3Q9JJR7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ascl3Q9JJR7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ascl3Q9JJR7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ascl3Q9JJR7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ascl3Q9JJR7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ascl3Q9JJR7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ascl3Q9JJR7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ascl3Q9JJR7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ascl3Q9JJR7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ascl3Q9JJR7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ascl3Q9JJR7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ascl3Q9JJR7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ascl3Q9JJR7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ascl3Q9JJR7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ascl3Q9JJR7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ascl3Q9JJR7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ascl3Q9JJR7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ascl3Q9JJR7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ascl3Q9JJR7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms