Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf2ird1Q9JI57 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf2ird1Q9JI57 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf2ird1Q9JI57 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf2ird1Q9JI57 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf2ird1Q9JI57 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf2ird1Q9JI57 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf2ird1Q9JI57 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf2ird1Q9JI57 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf2ird1Q9JI57 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf2ird1Q9JI57 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf2ird1Q9JI57 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf2ird1Q9JI57 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf2ird1Q9JI57 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf2ird1Q9JI57 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gtf2ird1Q9JI57 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtf2ird1Q9JI57 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtf2ird1Q9JI57 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtf2ird1Q9JI57 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtf2ird1Q9JI57 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtf2ird1Q9JI57 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtf2ird1Q9JI57 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtf2ird1Q9JI57 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtf2ird1Q9JI57 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf2ird1Q9JI57 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf2ird1Q9JI57 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf2ird1Q9JI57 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf2ird1Q9JI57 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf2ird1Q9JI57 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf2ird1Q9JI57 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf2ird1Q9JI57 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf2ird1Q9JI57 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf2ird1Q9JI57 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf2ird1Q9JI57 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf2ird1Q9JI57 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf2ird1Q9JI57 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf2ird1Q9JI57 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtf2ird1Q9JI57 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtf2ird1Q9JI57 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtf2ird1Q9JI57 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtf2ird1Q9JI57 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtf2ird1Q9JI57 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtf2ird1Q9JI57 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtf2ird1Q9JI57 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtf2ird1Q9JI57 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtf2ird1Q9JI57 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf2ird1Q9JI57 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf2ird1Q9JI57 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf2ird1Q9JI57 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf2ird1Q9JI57 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf2ird1Q9JI57 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf2ird1Q9JI57 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf2ird1Q9JI57 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf2ird1Q9JI57 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf2ird1Q9JI57 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf2ird1Q9JI57 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf2ird1Q9JI57 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gtf2ird1Q9JI57 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gtf2ird1Q9JI57 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Gtf2ird1Q9JI57 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gtf2ird1Q9JI57 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gtf2ird1Q9JI57 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gtf2ird1Q9JI57 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf2ird1Q9JI57 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf2ird1Q9JI57 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf2ird1Q9JI57 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf2ird1Q9JI57 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf2ird1Q9JI57 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf2ird1Q9JI57 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf2ird1Q9JI57 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf2ird1Q9JI57 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf2ird1Q9JI57 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf2ird1Q9JI57 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf2ird1Q9JI57 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf2ird1Q9JI57 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf2ird1Q9JI57 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf2ird1Q9JI57 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf2ird1Q9JI57 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf2ird1Q9JI57 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtf2ird1Q9JI57 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtf2ird1Q9JI57 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtf2ird1Q9JI57 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtf2ird1Q9JI57 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtf2ird1Q9JI57 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtf2ird1Q9JI57 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtf2ird1Q9JI57 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf2ird1Q9JI57 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf2ird1Q9JI57 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf2ird1Q9JI57 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf2ird1Q9JI57 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf2ird1Q9JI57 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf2ird1Q9JI57 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtf2ird1Q9JI57 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtf2ird1Q9JI57 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtf2ird1Q9JI57 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtf2ird1Q9JI57 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtf2ird1Q9JI57 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms