Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atg7Q9D906 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atg7Q9D906 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atg7Q9D906 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atg7Q9D906 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atg7Q9D906 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atg7Q9D906 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atg7Q9D906 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atg7Q9D906 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Atg7Q9D906 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atg7Q9D906 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atg7Q9D906 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atg7Q9D906 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atg7Q9D906 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atg7Q9D906 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atg7Q9D906 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atg7Q9D906 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atg7Q9D906 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atg7Q9D906 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atg7Q9D906 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atg7Q9D906 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atg7Q9D906 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atg7Q9D906 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atg7Q9D906 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atg7Q9D906 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atg7Q9D906 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atg7Q9D906 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atg7Q9D906 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Atg7Q9D906 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atg7Q9D906 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atg7Q9D906 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atg7Q9D906 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atg7Q9D906 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atg7Q9D906 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atg7Q9D906 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atg7Q9D906 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atg7Q9D906 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Atg7Q9D906 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atg7Q9D906 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atg7Q9D906 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atg7Q9D906 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atg7Q9D906 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atg7Q9D906 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atg7Q9D906 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atg7Q9D906 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atg7Q9D906 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atg7Q9D906 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atg7Q9D906 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atg7Q9D906 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atg7Q9D906 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atg7Q9D906 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atg7Q9D906 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atg7Q9D906 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atg7Q9D906 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atg7Q9D906 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atg7Q9D906 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atg7Q9D906 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atg7Q9D906 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atg7Q9D906 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atg7Q9D906 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atg7Q9D906 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Atg7Q9D906 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Atg7Q9D906 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atg7Q9D906 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atg7Q9D906 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Atg7Q9D906 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Atg7Q9D906 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atg7Q9D906 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atg7Q9D906 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atg7Q9D906 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atg7Q9D906 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Atg7Q9D906 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atg7Q9D906 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atg7Q9D906 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atg7Q9D906 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atg7Q9D906 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg7Q9D906 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg7Q9D906 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg7Q9D906 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg7Q9D906 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg7Q9D906 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg7Q9D906 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg7Q9D906 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg7Q9D906 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg7Q9D906 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg7Q9D906 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg7Q9D906 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg7Q9D906 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg7Q9D906 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg7Q9D906 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg7Q9D906 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atg7Q9D906 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Atg7Q9D906 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atg7Q9D906 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atg7Q9D906 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atg7Q9D906 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Atg7Q9D906 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atg7Q9D906 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg7Q9D906 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg7Q9D906 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 187.7 ms