Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc81Q9D5W4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc81Q9D5W4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc81Q9D5W4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc81Q9D5W4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc81Q9D5W4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc81Q9D5W4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc81Q9D5W4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc81Q9D5W4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc81Q9D5W4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc81Q9D5W4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc81Q9D5W4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc81Q9D5W4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc81Q9D5W4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc81Q9D5W4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc81Q9D5W4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc81Q9D5W4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc81Q9D5W4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc81Q9D5W4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc81Q9D5W4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc81Q9D5W4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc81Q9D5W4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc81Q9D5W4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc81Q9D5W4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc81Q9D5W4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc81Q9D5W4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc81Q9D5W4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc81Q9D5W4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc81Q9D5W4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc81Q9D5W4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc81Q9D5W4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc81Q9D5W4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc81Q9D5W4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc81Q9D5W4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc81Q9D5W4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc81Q9D5W4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc81Q9D5W4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc81Q9D5W4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc81Q9D5W4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc81Q9D5W4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc81Q9D5W4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc81Q9D5W4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc81Q9D5W4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc81Q9D5W4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc81Q9D5W4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc81Q9D5W4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc81Q9D5W4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc81Q9D5W4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc81Q9D5W4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc81Q9D5W4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc81Q9D5W4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc81Q9D5W4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc81Q9D5W4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc81Q9D5W4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc81Q9D5W4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc81Q9D5W4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc81Q9D5W4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc81Q9D5W4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc81Q9D5W4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc81Q9D5W4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc81Q9D5W4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc81Q9D5W4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc81Q9D5W4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc81Q9D5W4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc81Q9D5W4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc81Q9D5W4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc81Q9D5W4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc81Q9D5W4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc81Q9D5W4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc81Q9D5W4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc81Q9D5W4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc81Q9D5W4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc81Q9D5W4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc81Q9D5W4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc81Q9D5W4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc81Q9D5W4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc81Q9D5W4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc81Q9D5W4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc81Q9D5W4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc81Q9D5W4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc81Q9D5W4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc81Q9D5W4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc81Q9D5W4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc81Q9D5W4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc81Q9D5W4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc81Q9D5W4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc81Q9D5W4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc81Q9D5W4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc81Q9D5W4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc81Q9D5W4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc81Q9D5W4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc81Q9D5W4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc81Q9D5W4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc81Q9D5W4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc81Q9D5W4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc81Q9D5W4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc81Q9D5W4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc81Q9D5W4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc81Q9D5W4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc81Q9D5W4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.9 ms