Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ84

Ubl4b, Ubiquitin-like protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl4bQ9CQ84 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
Ubl4bQ9CQ84 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Ubl4bQ9CQ84 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Ubl4bQ9CQ84 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Ubl4bQ9CQ84 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Ubl4bQ9CQ84 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Ubl4bQ9CQ84 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Ubl4bQ9CQ84 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Ubl4bQ9CQ84 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Ubl4bQ9CQ84 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Ubl4bQ9CQ84 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Ubl4bQ9CQ84 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
Ubl4bQ9CQ84 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Ubl4bQ9CQ84 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Ubl4bQ9CQ84 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Ubl4bQ9CQ84 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
Ubl4bQ9CQ84 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Ubl4bQ9CQ84 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Ubl4bQ9CQ84 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Ubl4bQ9CQ84 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Ubl4bQ9CQ84 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Ubl4bQ9CQ84 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Ubl4bQ9CQ84 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Ubl4bQ9CQ84 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Ubl4bQ9CQ84 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Ubl4bQ9CQ84 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Ubl4bQ9CQ84 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Ubl4bQ9CQ84 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Ubl4bQ9CQ84 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Ubl4bQ9CQ84 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
Ubl4bQ9CQ84 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Ubl4bQ9CQ84 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Ubl4bQ9CQ84 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Ubl4bQ9CQ84 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Ubl4bQ9CQ84 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Ubl4bQ9CQ84 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Ubl4bQ9CQ84 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Ubl4bQ9CQ84 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Ubl4bQ9CQ84 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
Ubl4bQ9CQ84 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
Ubl4bQ9CQ84 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC36.57■■■■□ 3.44
Ubl4bQ9CQ84 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
Ubl4bQ9CQ84 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
Ubl4bQ9CQ84 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Ubl4bQ9CQ84 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
Ubl4bQ9CQ84 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Ubl4bQ9CQ84 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Ubl4bQ9CQ84 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Ubl4bQ9CQ84 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
Ubl4bQ9CQ84 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Ubl4bQ9CQ84 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Ubl4bQ9CQ84 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Ubl4bQ9CQ84 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Ubl4bQ9CQ84 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Ubl4bQ9CQ84 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Ubl4bQ9CQ84 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
Ubl4bQ9CQ84 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Ubl4bQ9CQ84 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
Ubl4bQ9CQ84 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
Ubl4bQ9CQ84 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
Ubl4bQ9CQ84 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Ubl4bQ9CQ84 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Ubl4bQ9CQ84 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Ubl4bQ9CQ84 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
Ubl4bQ9CQ84 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Ubl4bQ9CQ84 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Ubl4bQ9CQ84 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Ubl4bQ9CQ84 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Ubl4bQ9CQ84 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Ubl4bQ9CQ84 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Ubl4bQ9CQ84 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
Ubl4bQ9CQ84 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Ubl4bQ9CQ84 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Ubl4bQ9CQ84 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Ubl4bQ9CQ84 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Ubl4bQ9CQ84 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Ubl4bQ9CQ84 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Ubl4bQ9CQ84 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Ubl4bQ9CQ84 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Ubl4bQ9CQ84 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Ubl4bQ9CQ84 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Ubl4bQ9CQ84 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Ubl4bQ9CQ84 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Ubl4bQ9CQ84 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Ubl4bQ9CQ84 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Ubl4bQ9CQ84 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Ubl4bQ9CQ84 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Ubl4bQ9CQ84 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Ubl4bQ9CQ84 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Ubl4bQ9CQ84 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
Ubl4bQ9CQ84 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Ubl4bQ9CQ84 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Ubl4bQ9CQ84 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Ubl4bQ9CQ84 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Ubl4bQ9CQ84 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Ubl4bQ9CQ84 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Ubl4bQ9CQ84 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Ubl4bQ9CQ84 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Ubl4bQ9CQ84 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Ubl4bQ9CQ84 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms