Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Fyco1Q8VDC1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Fyco1Q8VDC1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Fyco1Q8VDC1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Fyco1Q8VDC1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Fyco1Q8VDC1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Fyco1Q8VDC1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Fyco1Q8VDC1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
Fyco1Q8VDC1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
Fyco1Q8VDC1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Fyco1Q8VDC1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Fyco1Q8VDC1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Fyco1Q8VDC1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Fyco1Q8VDC1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Fyco1Q8VDC1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Fyco1Q8VDC1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Fyco1Q8VDC1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Fyco1Q8VDC1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Fyco1Q8VDC1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Fyco1Q8VDC1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Fyco1Q8VDC1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Fyco1Q8VDC1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Fyco1Q8VDC1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Fyco1Q8VDC1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Fyco1Q8VDC1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Fyco1Q8VDC1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Fyco1Q8VDC1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Fyco1Q8VDC1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Fyco1Q8VDC1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Fyco1Q8VDC1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Fyco1Q8VDC1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Fyco1Q8VDC1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Fyco1Q8VDC1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Fyco1Q8VDC1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Fyco1Q8VDC1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Fyco1Q8VDC1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Fyco1Q8VDC1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Fyco1Q8VDC1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Fyco1Q8VDC1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Fyco1Q8VDC1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Fyco1Q8VDC1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Fyco1Q8VDC1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Fyco1Q8VDC1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Fyco1Q8VDC1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Fyco1Q8VDC1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Fyco1Q8VDC1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Fyco1Q8VDC1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Fyco1Q8VDC1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Fyco1Q8VDC1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Fyco1Q8VDC1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Fyco1Q8VDC1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Fyco1Q8VDC1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
Fyco1Q8VDC1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Fyco1Q8VDC1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Fyco1Q8VDC1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Fyco1Q8VDC1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Fyco1Q8VDC1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Fyco1Q8VDC1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Fyco1Q8VDC1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Fyco1Q8VDC1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Fyco1Q8VDC1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Fyco1Q8VDC1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Fyco1Q8VDC1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Fyco1Q8VDC1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
Fyco1Q8VDC1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Fyco1Q8VDC1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Fyco1Q8VDC1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Fyco1Q8VDC1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Fyco1Q8VDC1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Fyco1Q8VDC1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Fyco1Q8VDC1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Fyco1Q8VDC1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Fyco1Q8VDC1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Fyco1Q8VDC1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Fyco1Q8VDC1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Fyco1Q8VDC1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
Fyco1Q8VDC1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Fyco1Q8VDC1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Fyco1Q8VDC1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Fyco1Q8VDC1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Fyco1Q8VDC1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Fyco1Q8VDC1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Fyco1Q8VDC1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Fyco1Q8VDC1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC33.07■■■□□ 2.89
Fyco1Q8VDC1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Fyco1Q8VDC1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Fyco1Q8VDC1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Fyco1Q8VDC1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Fyco1Q8VDC1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Fyco1Q8VDC1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Fyco1Q8VDC1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Fyco1Q8VDC1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Fyco1Q8VDC1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Fyco1Q8VDC1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Fyco1Q8VDC1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Fyco1Q8VDC1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Fyco1Q8VDC1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Fyco1Q8VDC1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Fyco1Q8VDC1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
Fyco1Q8VDC1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms